Le principali differenze riguardano la struttura di questi microbi. Batteri e virus sono diversi e questo li porta a reagire diversamente ai farmaci oggi disponibili. Il batterio è un organismo unicellulare che presenta un involucro rigido. Una membrana sottile e gelatinosa avvolge il fluido interno della cellula. La forma di un batterio può variare e assumere forma sferica, a bastoncino o anche a spirale. Sono capaci di creare copie di sé stessi. Possono vivere in più contesti, da quelli estremamente caldi ai più freddi. Esistono molti batteri innocui, come quelli presenti nell'intestino utili alla digestione. Solo l'1% di essi può provocare un'infezione batterica.